Science｜季节性流感若何传播？复旦领衔国外团队发文！

转自：上不雅新闻

尽管国外科学界已对

季节性流感进行深化商量

但流感疫情在全球时空

扩散经过偏激驱动机制仍不解晰

行动席卷全球的全球卫生危急

COVID-19对流感的全球传播和

进化动态的影响也有待回报

复旦全球卫生学院余宏杰训诲团队

与国外顶尖系统进化商量团队配合

商量发现了COVID-19大流行

前中后季节性流感的

全球时空传播动态及驱动机制

为制定流感全球防控措施

提供了热切依据

关系效果以“COVID-19 pandemic interventions reshaped the global dispersal of seasonal influenza viruses”为题

在《科学》（Science）杂志发表

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国外配合，

捕捉COVID-19大流行时代

季节性流感的前沿科常识题

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流感病毒是20世纪以来独一不错引起周期性全球大流行的病原体，全球每年有300-500万季节性流感重症病例。在我国，每年有约9万名患者因季节性流感所致的呼吸系统疾病关系的逾额亏欠。

尽管医学界在流感的流行病学领域深耕已久，但还无法突破缺点表面和手艺，以终结头顶的“乌云”——精准解析流感疫情每年在全球的发生行动、时空扩散经过偏激驱动机制。

濒临这一国外科学繁难，余宏杰团队接纳渐进式表面和手艺突破念念路。领先从疾病当然史起程，突破疫情发生行动已有领会，再解析个体和群体的疾病处事，临了详情其特异的传播荟萃和演化机制。系列效果早期发表在Lancet、BMJ、Science等期刊。

在前期深化商量的基础上，余宏杰敏感察觉到，COVID-19大流行时代施加的非药物搅扰措施纰漏了季节性流感传播的“常态”。“尽管感染不同呼吸说念传染病病原体换取的特异性免疫不同，但非药物性搅扰措施对其传播的阻断作用是共通的。”

在建议了COVID-19大流行影响季节性流感全球传播模式的假定后，复旦大学全球卫生学院2022级博士商量生陈志元在导师余宏杰的指导下，从边幅大流行时代全球季节性流感病毒的行动强度脱手，发现其全体行动水平显赫缩小，且其中的B/Yamagata谱系自2020年3月后似乎“鸣锣喝道”。但陪同全球针对COVID-19非药物性搅扰措施的渐渐打消，流感病毒的行动水平启动渐渐规复。

在初步考据的基础上，余宏杰启动念念考若何阐发COVID-19大流行对季节性流感流行的影响。“以基因组数据为切入点，开展基因组系统进化能源学商量也许不错经管此问题，但咱们团队在此领域的商量基础相比薄弱。”他曾在一次组会上说说念。

为进一步探索COVID-19大流行对季节性流感全球传播和进化的时势的影响，余宏杰与牛津大学、英国皇家兽医学院和比利时鲁汶大学等国外顶尖商量团队开启了跨学科、跨区域、跨话语的配合商量。

抽丝剥茧，

探索季节性流感

全球传播的模式和驱动成分

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“科研革命不是一蹴而就的。”余宏杰说。在科研效果的背后，是团队卖头卖脚的科研处事和无时无刻的深厚蕴蓄。

2023年6月至8月，余宏杰领衔的国外配合团队初步重建了COVID-19大流行前、中、后全球季节性流感的传播模式。更进一局势，余宏杰领导团队进入更多时刻细化商量有运筹帷幄，反复打磨缺点细节，更换模子框架、优化多源数据等。

商量进一步聚焦在重建大流行前期（2017年1月-2020年3月）、大流行期的急性阶段（2020年4月-2021年3月）、大流行期的漂浮阶段（2021年4月-2023年4月）和大流行后期（2023年5月-2024年3月）四个阶段的全球季节性流感传播动态。

余宏杰团队整合全球流感流行病学监测数据、基因序列数据和东说念主群航空流量数据，将全球分红了12个区域，在贝叶斯系统能源学的框架下重构了四个时期的季节性流感传播模式，并忖度了传播的关系参数和潜在驱动成分。

全球航空流量变化及在流感传播中的作用

（A-C：不同期期的区域间航空流量；D：各区域相对相差航空流量；E-F：不同期期航空流量充足值和模式漫衍；G：流感传播驱动成分）

经过进一步的商量，团队发现季节性流感的行动水善良区域间航空流量均资格了“下过期规复”的经过。在时刻异质性的系统能源学模子框架下进一步蚁合基因序列数据，商量还发现区域间航空流量是四个时期全球季节性流感传播的主要驱动成分。

为评估大流行时代不同流感季的传播强度和传播模式雷同性，团队又专揽多维程序分析缺点，发现大流行后期，全球季节性流感传播的模式和强度已基本规复至大流行前水平。

以甲型H3N2流感病毒为例，团队进一步商量了非洲、东南亚和南亚地区的毒株轮回历久性，发现其在大流行时代显赫升高，教唆相对独处的进化和轮回。通过构建分层贝叶斯回首模子，团队发现抗原漂移和区域间东说念主群挪动与大流行时代轮回历久性的升高显赫关系。

全球季节性流感的传播动态

（A：不同型别/谱系季节性流感的传播强度；B-E：不同型别/谱系季节性流感在不同期期的传播荟萃）

本商量明确了针对COVID-19的非药物性搅扰措施对区域流感病毒进化/轮回独处性的影响，以及大流行后流感传播模式的适应规复。商量收尾强调了加强呼吸说念病原体的病毒学和基因监测、实时调度疫苗接种战略和监测观点的热切性，对异日大流行的详尽玩忽提供了实证依据，将加深大流行情境下对季节性呼吸说念病原体传播和进化的团结。

《科学》（Science）杂志剪辑及审稿东说念主对此商量论文进行了高度评价，觉得该商量“提供了对季节性流感谱系能源学的最新团结，也定量阐发了大流行时代东说念主群挪动模式的变化在全球季节性流感传播的作用”。

依托资源，组建寰球一流

多学科交叉商量团队

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自2017年加入复旦大学上海医学院以来，余宏杰奋勉于打造一支“干湿蚁合”的新发传染病多学科交叉商量团队。跟着复旦大学鼎力鼓动全球卫生与适应医学与关系交叉学科一体化诱骗，在全球卫生学院、上海市紧要传染病和生物安全商量院的鼎力扶持下，余宏杰详情了团队诱骗重心和东说念主才培养观点——汇注多学科交叉的详尽上风，培养复合型革命东说念主才。

历时7年，余宏杰组建了一支寰球一流的交叉科研团队，包括后生磨真金不怕火6东说念主、科研助理和博士后5东说念主、博士和硕士商量生38东说念主，专科配景遮蔽数学、表面物理、生物工程、地舆信息系统等学科。其领衔的全球卫生安全训诲部重心实际室在训诲部组织的五年评估中获评“优秀”，团队获复旦大学“钟扬式科研团队”等多项荣誉。

余宏杰指导与团队成员开展实际

论文的独处第一作家恰是余宏杰的团队成员陈志元。2020年，陈志元从全球卫生学院保研至余宏杰团队，启动接受系统、完好的多学科交叉科研测验，并于2024年获首批国度当然基金委博士生名堂资助。

为了掌捏病毒基因组系统进化能源学，在余宏杰的荧惑和指导下，陈志元突破团队原有观点，于昨年6月赶赴牛津大学，开启了为期一年的闇练和配合商量。“这段交流资格使我了解了系统进化商量领域最前沿的手艺和商量观点，也促进了中英两边团队的配合与交流。”陈志元默示。

余宏杰领导团队开展了基于流行病学、传染病学、数学、物理学等多学科交叉商量，科研硕果累累。团队重建了A（H1N1）pdm09流感病毒感染后的疾病当然程度，并详情了病毒载量动态变化行动（BMJ 2010），经管了疾病当然史重建经过中概略情趣的繁难。团队解析了包括禽流感病毒（avian influenza virus, AIV）、猪流感病毒（swine influenza virus, SIV）等东说念主感染动物源性流感病毒和新式冠状病毒感染传播的当然演进历程（Lancet2013a, 2013b, 2014;Lancet Infectious Diseases2016, 2017, 2020; Science 2021）。此外，团队还详情了我国季节性流感病毒分型别和毒株区域流行的季节性和疾病处事（PLoS Medicine2013; Lancet Public Health 2019, Lancet Microbe 2023），并应用于AIV, SIV, SARS-CoV-2高精度感染疾病谱的重建和驱动成分商量（Nature Communications2020;Nature Medicine2022;Lancet Global Health2021）。

在此前从未涉足的结构化和荟萃拓扑传染病建模领域，余宏杰团队突破性设置了H7N9和SARS-CoV-2病毒传播荟萃重构表面缺点，解析了感染高风险东说念主群偏激斗争荟萃与H7N9/SARS-CoV-2病毒当然轮回、东说念主为搅扰间的多维交互博弈机制（Lancet2014;Nature Communications2014, 2020;BMJ2020;Science2021;Science Advances2021;Nature Human Behaviour2021）。

“COVID-19除外的其他大流行是否也如斯？”在本次商量的基础上，余宏杰正领导团队紧锣密饱读地规画，考据21世纪以来两次大流行（2009年H1N1大流行和COVID-19大流行）对东南亚地区季节性流感传播和进化影响的相反。

丰厚的科研效果源自恒久以来的蕴蓄。2006-2017年间，余宏杰在中国疾病适应放胆中心开展的不息、深化的东说念主感染禽流感病毒系列商量让他初次站上国外舞台，Lancet主刊为他刊登东说念主物专访“Hongjie Yu: monitoring avian influenza in China”，象征着国外科学界对他系列科研处事的初步认同。

在传染病的东说念主体免疫“解码”领域，余宏杰团队耗时8年，承受了“高进入、零产出”的恒久压力，最终完成了大规模东说念主群部队商量平台和体外免疫会诊平台的搭建。8年后，“肠说念病毒EV-A71/CVA16母传和当然感染换取抗体动态变化”、“麻疹母传和疫苗换取免疫应答机制”、“A(H1N1)pdm09流感病毒毒株间的交叉免疫力”等革命表面突破的高质地科研效果才陆续发表。

从SARS，到东说念主感染禽流感H5N1、H5N6和H7N9病毒，再到季节性流感和COVID-19，团队革命效果泛滥成灾。异日，余宏杰团队将链接面向国度人命健康领域紧要需乞降国外前沿，深化商量紧要新发传染病疫情发生和传播机理、个体及群体免疫应答机制，提供保险个体和东说念主群健康的原创性基础表面，为东说念主民人命健康添砖加瓦。

论文流畅：

https://www.science.org/doi/10.1126/science.adq3003